Potraviny, které vkládáme do úst ovlivňují náš ústní mikrobiom, který obsahuje okolo 700 bakteriálních druhů, po střevech jde o druhý nejdiverzifikovanější mikrobiom.
Ústní mikroflóra je tvořena bakteriemi, které jsou zdraví prospěšné a bakteriemi patogenního typu. U zdravého jedince je udržován specifický poměr mezi těmito tábory, kdy převládají bakterie zdraví prospěšné. Pokud dojde k přemnožení patogenních bakterií, tak se tento stav označuje jako dysbióza. Dysbióza ústní mikrobioty způsobuje odhalování krčků, zánět dásní, paradontózu a zubní kaz.
Ústní mikrobiom ovlivňuje střevní mikrobiom.